经皮穿刺活检创伤小，它的绝对禁忌症只有一个，即病人有明显出血倾向且不能纠正者。因这种病人活检后很可能出血不止。经合理治疗能够纠正的出血性疾病仍可行肾活检。

此外还有一些相对禁忌症：

(1)中、重度高血压(血压超过21．33／14．66kPa)，因手术后易出血或形成动静脉瘘，因而在活检前必须把血压控制在正常范围内，否则不宜做肾活检。

(2)正在进行抗凝治疗者，因难以止血不宜活检。如血液透析病人需要活检则活检前后血液透析时需小量肝素或体外肝素化抗凝，血液透析24小时后才能进行肾活检。

(3)慢性肾功能衰竭肾脏已萎缩者，不仅由于肾脏萎缩穿刺困难，也由于肾组织已高度纤维化，对原发肾病诊断已无帮助，肾活检没有价值。

(4)孤立肾马蹄肾或另一侧肾功能已丧失者不能做肾活检。因为万一活检出现严重并发症需手术摘除时，患者便因无肾而难以存活。

(5)肾盂肾炎、肾结核、肾脓肿或肾周脓肿等活动性肾感染，穿刺易造成炎症扩散，活检应在炎症完全控制后进行。

(6)肾肿瘤不能以常规方式穿刺；否则会导致肿瘤扩散。肾血管瘤、肾囊肿、多囊肾也不宜肾穿刺。

(7)肾积水只有在梗阻解除后才能进行肾活检。

(8)心力衰竭、周围循环衰竭或全身情况很差者不宜肾活检。

(9)精神失常者不能配合操作，不能行肾活检。

(10)过度肥胖病人或严重水肿病人因B超难以定位且穿刺困难，成功率低，一般不做经皮穿刺肾活检。

(11)高度腹水病人因难以俯卧配合穿刺，同时若穿刺针误入腹腔，则腹水可沿穿刺道漏出，甚至继发感染，所以必须在消除腹水后才能进行肾穿刺。